No passado o Esporte Clube Náutico Vitória Vitória foi criado em 15 de março de 1993 com o nome fantasia ♣ "União de Vitória", criado depois de uma competição que tinha como objetivo, formar um clube de futebol brasileiro para os ♣ meninos mais velhos nas divisões superiores de base.
No entanto ao longo dessa década o Vitória Esporte Clube Vitória foi mudando ♣ de nome devido a desentendimentos da diretoria com a escola nacional da federação em questão, uma vez que foi acusado ♣ em 2012 de ter plagiado com a federação brasileira de futebol de base.No início,
o Vitória começou as suas atividades de ♣ base da seguinte maneira: em 1997, foi criado o Esporte Clube Vitória Sport Club com o nome fantasia "Vitória de ♣ Vitória", que posteriormente foi rebatizado Esporte Clube Vitória Vitória por duas outras razões.
Na criação do clube, houve uma reestruturação na ♣ equipe e também o início de um planejamento para fazer os jogos internacionais no exterior.
A primeira competição que o clube ♣ participou foi a Copa do Brasil de Futebol de 1997.